Наскоро публикувана статия в списанието Nature микробиология описва подробно динамиката на разпространението на коронавирус в Бразилия и предоставя портрет на първите две вълни на covid-19. Сред другите резултати, работата обсъжда ролята на мобилността на населението, мерките за ограничаване на пътуването и появата на първите варианти в разпространението на болестта.
ПУБЛИЧНОСТ
„Генерирането на геноми и анализ на данни е от решаващо значение за разбирането и наблюдението на еволюцията на патогените, особено като се има предвид циркулацията на множество микроорганизми в Бразилия, като Sars-CoV-2, денга, зика, чикунгуня и маймунската шарка, между другото. Това подчертава необходимостта системите за наблюдение да се поддържат активни“, обяснява първият автор на статията, гостуващият изследовател в лабораторията за вируси IOC/Fiocruz Flavivirus, Марта Джованети.
Водено от института Освалдо Круз (IOC/Fiocruz), института Бутантан и университета в Сао Пауло (USP), проучването включва участието на повече от сто учени, които работят в институции в осем държави: Бразилия, Парагвай, Италия, Южна Южна Африка, Обединеното кралство, Португалия, Съединените щати и Австралия.
Геноми от цяла Бразилия
Проучването анализира геноми от цяла Бразилия. На картата кръговете показват обема на генетичните последователности, съответстващи на всяко състояние. В графиката цветовете показват различните открити вирусни линии.
ПУБЛИЧНОСТ
„Като изследователи, ние имаме задължението да генерираме данни, за да се опитаме да разберем процесите на разпространение на патогени с ендемичен и епидемичен потенциал и в същото време да информираме здравните власти и населението. Предпечатът позволява това бързо споделяне“, посочи изследователят Марта.
Streaming
Проучването посочва, че повечето въвеждания на коронавирус в Бразилия са настъпили преди прилагането на ограничителни мерки, като затваряне на училища и предприятия. По-голямата част от щамовете са въведени от Европа, с приблизително 114 независими въвеждане преди април 2020 г. В най-интензивния период на ограничения, от април до август 2020 г., са регистрирани 33 въвеждане на коронавирус.
Въпреки големия брой вноси, имаше приблизително 10 пъти повече случаи на износ на щамове от Бразилия към чужбина, като се има предвид целият анализиран период.
ПУБЛИЧНОСТ
Обширна база данни
Изследването секвенира повече от 3,8 генома на Sars-CoV-2, отнасящи се до случаи, регистрирани в осем бразилски щата между февруари 2020 г. и юни 2021 г. В допълнение към IOC/Fiocruz, Instituto Butantan и USP, Централните лаборатории за обществено здраве (Lacens) от пет бразилски щата и Парагвай, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) и Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) си сътрудничиха при секвенирането.
Обемът на последователностите представлява около 20% от общите геноми, декодирани в Бразилия по време на периода на изследване. В анализите изследователите анализираха и около 13 хиляди генома, налични в публични бази данни, отнасящи се до случаи, регистрирани в страната през периода, достигайки общо приблизително 17 хиляди генома. Анализирана е и информация относно случаи в Парагвай.
Източник: информационна агенция Fiocruz
