En artikel for nylig offentliggjort i magasinet Natur Mikrobiologi beskriver dynamikken i coronavirus-cirkulationen i Brasilien og giver et portræt af de to første bølger af covid-19. Blandt andre resultater diskuterer arbejdet befolkningens mobilitets rolle, rejsebegrænsende foranstaltninger og fremkomsten af de første varianter i spredningen af sygdommen.
ANNONCER
"Genereringen af genomer og dataanalyse er afgørende for at forstå og overvåge udviklingen af patogener, især i betragtning af cirkulationen af flere mikroorganismer i Brasilien, såsom Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya og abekopper, blandt andre. Dette understreger behovet for at holde overvågningssystemer aktive”, forklarer artiklens første forfatter, gæsteforskeren ved IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory, Marta Giovanetti.
Anført af Oswaldo Cruz Institute (IOC/Fiocruz), Butantan Institute og University of São Paulo (USP), omfattede undersøgelsen deltagelse af mere end hundrede videnskabsmænd, som arbejder i institutioner i otte lande: Brasilien, Paraguay, Italien, Syd. Afrika Syd, Storbritannien, Portugal, USA og Australien.
Genomer fra hele Brasilien
Undersøgelsen analyserede genomer fra hele Brasilien. På kortet angiver cirklerne mængden af genetiske sekvenser, der svarer til hver tilstand. I grafen angiver farverne de forskellige detekterede virale afstamninger.
ANNONCER
”Som forskere har vi en forpligtelse til at generere data for at forsøge at forstå spredningsprocesserne for patogener med endemisk og epidemisk potentiale og samtidig informere sundhedsmyndighederne og befolkningen. Fortrykket giver mulighed for denne hurtige deling”, påpegede forsker Marta.
Transmissionão
Undersøgelsen påpeger, at de fleste introduktioner af coronavirus i Brasilien fandt sted før implementeringen af restriktive foranstaltninger, såsom lukning af skoler og virksomheder. Størstedelen af stammer blev introduceret fra Europa, med anslået 114 uafhængige introduktioner før april 2020. I den mest intense periode med restriktioner, fra april til august 2020, blev der registreret 33 introduktioner af coronavirus.
På trods af det store antal importer var der ca. 10 gange flere eksportbegivenheder af stammer fra Brasilien til udlandet, når man tager hele den analyserede periode i betragtning.
ANNONCER
Omfattende database
Forskningen sekventerede mere end 3,8 Sars-CoV-2-genomer, der refererede til tilfælde registreret i otte brasilianske stater mellem februar 2020 og juni 2021. Ud over IOC/Fiocruz, Instituto Butantan og USP, Central Public Health Laboratories (Lacens) fra fem brasilianske stater og Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) og Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) samarbejdede med sekventeringen.
Volumenet af sekvenser repræsenterer omkring 20% af de samlede genomer, der er afkodet i Brasilien i løbet af undersøgelsesperioden. I analyserne analyserede forskerne også omkring 13 tusinde genomer, der var tilgængelige i offentlige databaser, med henvisning til tilfælde registreret i landet i perioden, og nåede i alt op på cirka 17 tusinde genomer. Oplysninger om sager i Paraguay blev også analyseret.
Kilde: Fiocruz News Agency
