Ein kürzlich in der Zeitschrift veröffentlichter Artikel Natur Mikrobiologie beschreibt detailliert die Dynamik der Coronavirus-Zirkulation in Brasilien und bietet ein Porträt der ersten beiden Wellen von Covid-19. In der Arbeit werden unter anderem die Rolle der Bevölkerungsmobilität, Reisebeschränkungsmaßnahmen und die Entstehung erster Varianten bei der Ausbreitung der Krankheit erörtert.
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„Die Generierung von Genomen und die Datenanalyse sind von entscheidender Bedeutung für das Verständnis und die Überwachung der Entwicklung von Krankheitserregern, insbesondere angesichts der Verbreitung mehrerer Mikroorganismen in Brasilien, wie unter anderem Sars-CoV-2, Dengue-Fieber, Zika-Fieber, Chikungunya-Fieber und Affenpocken. Dies unterstreicht die Notwendigkeit, Überwachungssysteme aktiv zu halten“, erklärt die Erstautorin des Artikels, die Gastforscherin am IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory, Marta Giovanetti.
An der vom Oswaldo Cruz Institute (IOC/Fiocruz), dem Butantan Institute und der University of São Paulo (USP) geleiteten Studie nahmen mehr als hundert Wissenschaftler teil, die in Institutionen in acht Ländern arbeiten: Brasilien, Paraguay, Italien, Süditalien Afrika Süd, Vereinigtes Königreich, Portugal, Vereinigte Staaten und Australien.
Genome aus ganz Brasilien
Die Studie analysierte Genome aus ganz Brasilien. Auf der Karte geben die Kreise die Menge der genetischen Sequenzen an, die jedem Staat entspricht. In der Grafik geben die Farben die verschiedenen erkannten Viruslinien an.
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„Als Forscher stehen wir in der Pflicht, Daten zu generieren, um zu versuchen, Ausbreitungsprozesse von Krankheitserregern mit endemischem und epidemischem Potenzial zu verstehen und gleichzeitig Gesundheitsbehörden und die Bevölkerung zu informieren.“ Der Vorabdruck ermöglicht dieses schnelle Teilen“, betonte Forscherin Marta.
Übertragung
Die Studie weist darauf hin, dass die meisten Einschleppungen des Coronavirus in Brasilien vor der Umsetzung restriktiver Maßnahmen wie der Schließung von Schulen und Unternehmen erfolgten. Der Großteil der Stämme wurde aus Europa eingeschleppt, mit schätzungsweise 114 unabhängigen Einschleppungen vor April 2020. In der Zeit mit den stärksten Beschränkungen, von April bis August 2020, wurden 33 Einschleppungen des Coronavirus registriert.
Trotz der großen Zahl an Importen kam es über den gesamten analysierten Zeitraum etwa zehnmal häufiger zu Exportereignissen von Stämmen aus Brasilien ins Ausland.
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Umfangreiche Datenbank
Die Forschung sequenzierte mehr als 3,8 Sars-CoV-2-Genome und bezog sich dabei auf Fälle, die zwischen Februar 2020 und Juni 2021 in acht brasilianischen Bundesstaaten registriert wurden. Neben IOC/Fiocruz, Instituto Butantan und USP, Central Public Health Laboratories (Lazens) aus fünf brasilianischen Bundesstaaten und Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) und Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) arbeiteten bei der Sequenzierung zusammen.
Das Sequenzvolumen entspricht etwa 20 % des gesamten Genoms, das während des Untersuchungszeitraums in Brasilien entschlüsselt wurde. Im Rahmen der Analysen analysierten die Forscher auch etwa 13 Genome, die in öffentlichen Datenbanken verfügbar waren und sich auf Fälle bezogen, die in diesem Zeitraum im Land registriert wurden, und erreichten so eine Gesamtzahl von etwa 17 Genomen. Es wurden auch Informationen zu Fällen in Paraguay analysiert.
Quelle: Nachrichtenagentur Fiocruz
