Ένα άρθρο που δημοσιεύτηκε πρόσφατα στο περιοδικό Φύση Μικροβιολογία περιγράφει λεπτομερώς τη δυναμική της κυκλοφορίας του κορωνοϊού στη Βραζιλία και παρέχει ένα πορτρέτο των δύο πρώτων κυμάτων του covid-19. Μεταξύ άλλων αποτελεσμάτων, η εργασία συζητά τον ρόλο της κινητικότητας του πληθυσμού, τα μέτρα περιορισμού των ταξιδιών και την εμφάνιση των πρώτων παραλλαγών στην εξάπλωση της νόσου.
ΔΙΑΦΗΜΙΣΗ
«Η δημιουργία γονιδιωμάτων και ανάλυση δεδομένων είναι ζωτικής σημασίας για την κατανόηση και την παρακολούθηση της εξέλιξης των παθογόνων, ιδίως λαμβάνοντας υπόψη την κυκλοφορία πολλαπλών μικροοργανισμών στη Βραζιλία, όπως ο Sars-CoV-2, ο δάγγειος πυρετός, η ζίκα, η chikungunya και η ευλογιά των πιθήκων, μεταξύ άλλων. Αυτό υπογραμμίζει την ανάγκη να διατηρηθούν ενεργά τα συστήματα παρακολούθησης», εξηγεί η πρώτη συγγραφέας του άρθρου, η επισκέπτρια ερευνήτρια στο εργαστήριο IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory, Marta Giovanetti.
Με επικεφαλής το Ινστιτούτο Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), το Ινστιτούτο Butantan και το Πανεπιστήμιο του Σάο Πάολο (USP), η μελέτη περιελάμβανε τη συμμετοχή περισσότερων από εκατό επιστημόνων, οι οποίοι εργάζονται σε ιδρύματα σε οκτώ χώρες: Βραζιλία, Παραγουάη, Ιταλία, Νότια Νότια Αφρική, Ηνωμένο Βασίλειο, Πορτογαλία, Ηνωμένες Πολιτείες και Αυστραλία.
Γονιδιώματα από όλη τη Βραζιλία
Η μελέτη ανέλυσε γονιδιώματα από όλη τη Βραζιλία. Στο χάρτη, οι κύκλοι υποδεικνύουν τον όγκο των γενετικών αλληλουχιών που αντιστοιχούν σε κάθε κατάσταση. Στο γράφημα, τα χρώματα υποδεικνύουν τις διαφορετικές ιογενείς γενεές που εντοπίστηκαν.
ΔΙΑΦΗΜΙΣΗ
«Ως ερευνητές, έχουμε υποχρέωση να παράγουμε δεδομένα για να προσπαθήσουμε να κατανοήσουμε τις διαδικασίες διασποράς παθογόνων με ενδημικό και επιδημικό δυναμικό και, ταυτόχρονα, να ενημερώσουμε τις υγειονομικές αρχές και τον πληθυσμό. Η προεκτύπωση επιτρέπει αυτή τη γρήγορη κοινή χρήση», επεσήμανε η ερευνήτρια Μάρτα.
Ροή
Η μελέτη επισημαίνει ότι οι περισσότερες εισαγωγές κορωνοϊού στη Βραζιλία έγιναν πριν από την εφαρμογή περιοριστικών μέτρων, όπως το κλείσιμο σχολείων και επιχειρήσεων. Η πλειοψηφία των στελεχών εισήχθη από την Ευρώπη, με εκτιμώμενες 114 ανεξάρτητες εισαγωγές πριν από τον Απρίλιο του 2020. Στην πιο έντονη περίοδο περιορισμών, από τον Απρίλιο έως τον Αύγουστο του 2020, καταγράφηκαν 33 εισαγωγές του κορωνοϊού.
Παρά τον μεγάλο αριθμό εισαγωγών, υπήρξαν περίπου 10 φορές περισσότερες εξαγωγές στελεχών από τη Βραζιλία στο εξωτερικό, λαμβάνοντας υπόψη ολόκληρη την περίοδο που αναλύθηκε.
ΔΙΑΦΗΜΙΣΗ
Εκτεταμένη βάση δεδομένων
Η έρευνα ανέλυσε την αλληλουχία περισσότερων από 3,8 γονιδιωμάτων Sars-CoV-2 που αναφέρονται σε περιπτώσεις που καταγράφηκαν σε οκτώ πολιτείες της Βραζιλίας μεταξύ Φεβρουαρίου 2020 και Ιουνίου 2021. Εκτός από το IOC/Fiocruz, το Instituto Butantan και το USP, Central Public Health Laboratories ( Lacens) από πέντε πολιτείες της Βραζιλίας και Παραγουάη, το Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) και το Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) συνεργάστηκαν στη σειρά.
Ο όγκος των αλληλουχιών αντιπροσωπεύει περίπου το 20% του συνόλου των γονιδιωμάτων που αποκωδικοποιήθηκαν στη Βραζιλία κατά την περίοδο μελέτης. Στις αναλύσεις, οι ερευνητές ανέλυσαν επίσης περίπου 13 χιλιάδες γονιδιώματα που είναι διαθέσιμα σε δημόσιες βάσεις δεδομένων που αναφέρονται σε περιπτώσεις που καταγράφηκαν στη χώρα την περίοδο, φτάνοντας συνολικά περίπου 17 χιλιάδες γονιδιώματα. Αναλύθηκαν επίσης πληροφορίες σχετικά με κρούσματα στην Παραγουάη.
Πηγή: Πρακτορείο Ειδήσεων Fiocruz
