Un artículo publicado recientemente en la revista Naturaleza Microbiología detalla la dinámica de la circulación del coronavirus en Brasil y ofrece un retrato de las dos primeras oleadas de covid-19. Entre otros resultados, el trabajo analiza el papel de la movilidad de la población, las medidas de restricción de viajes y la aparición de las primeras variantes en la propagación de la enfermedad.
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“La generación de genomas y el análisis de datos es crucial para comprender y monitorear la evolución de patógenos, especialmente considerando la circulación de múltiples microorganismos en Brasil, como Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya y viruela simica, entre otros. Esto pone de relieve la necesidad de mantener activos los sistemas de seguimiento”, explica la primera autora del artículo, la investigadora visitante del Laboratorio de Flavivirus COI/Fiocruz, Marta Giovanetti.
Liderado por el Instituto Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), el Instituto Butantan y la Universidad de São Paulo (USP), el estudio contó con la participación de más de cien científicos, que actúan en instituciones de ocho países: Brasil, Paraguay, Italia, Sudamérica África Sur, Reino Unido, Portugal, Estados Unidos y Australia.
Genomas de todo Brasil
El Estudio analizó genomas de todo Brasil. En el mapa, los círculos indican el volumen de secuencias genéticas correspondientes a cada estado. En el gráfico, los colores indican los diferentes linajes virales detectados.
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“Como investigadores tenemos la obligación de generar datos para intentar comprender los procesos de dispersión de patógenos con potencial endémico y epidémico y, al mismo tiempo, informar a las autoridades sanitarias y a la población. La preimpresión permite este intercambio rápido”, señala la investigadora Marta.
Transmisión
El estudio señala que la mayoría de las introducciones de coronavirus en Brasil se produjeron antes de la implementación de medidas restrictivas, como el cierre de escuelas y negocios. La mayoría de las cepas se introdujeron desde Europa, con un estimado de 114 introducciones independientes antes de abril de 2020. En el período de restricciones más intenso, de abril a agosto de 2020, se registraron 33 introducciones del coronavirus.
A pesar del gran número de importaciones, hubo aproximadamente 10 veces más eventos de exportación de cepas de Brasil al exterior, considerando todo el período analizado.
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Amplia base de datos
La investigación secuenció más de 3,8 genomas de Sars-CoV-2 referentes a casos registrados en ocho estados brasileños entre febrero de 2020 y junio de 2021. Además del COI/Fiocruz, el Instituto Butantan y la USP, también participaron los Laboratorios Centrales de Salud Pública (Lacens) de cinco estados brasileños. y Paraguay, colaboraron en la secuenciación el Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) y el Hemocentro de Ribeirão Preto (SP).
El volumen de secuencias representa alrededor del 20% del total de genomas decodificados en Brasil durante el período de estudio. En los análisis, los investigadores también analizaron alrededor de 13 mil genomas disponibles en bases de datos públicas referentes a casos registrados en el país en el período, alcanzando un total de aproximadamente 17 mil genomas. También se analizó información sobre casos en Paraguay.
Fuente: Agencia de Noticias Fiocruz
