مقاله ای که به تازگی در این مجله منتشر شده است میکروبیولوژی طبیعت پویایی گردش ویروس کرونا در برزیل را شرح می دهد و تصویری از دو موج اول کووید-19 ارائه می دهد. در میان نتایج دیگر، این کار نقش تحرک جمعیت، اقدامات محدودیت سفر و ظهور اولین گونه‌ها در گسترش بیماری را مورد بحث قرار می‌دهد.
تبلیغات
تولید ژنوم و تجزیه و تحلیل داده‌ها برای درک و نظارت بر تکامل پاتوژن‌ها، به ویژه با توجه به گردش میکروارگانیسم‌های متعدد در برزیل، مانند Sars-CoV-2، دنگی، زیکا، چیکونگونیا و آبله میمون‌ها، حیاتی است. این نیاز به فعال نگه داشتن سیستم های نظارتی را برجسته می کند.» نویسنده اول مقاله، محقق مدعو در آزمایشگاه IOC/Fiocruz Flavivirus، Marta Giovanetti، توضیح می دهد.
این مطالعه که توسط موسسه اسوالدو کروز (IOC/Fiocruz)، موسسه بوتانتان و دانشگاه سائوپائولو (USP) رهبری می‌شود، شامل مشارکت بیش از صد دانشمند است که در مؤسسات هشت کشور برزیل، پاراگوئه، ایتالیا، جنوب کار می‌کنند. آفریقای جنوبی، انگلستان، پرتغال، ایالات متحده و استرالیا.
ژنوم از سراسر برزیل
این مطالعه ژنوم های سراسر برزیل را تجزیه و تحلیل کرد. روی نقشه، دایره ها حجم توالی های ژنتیکی مربوط به هر حالت را نشان می دهند. در نمودار، رنگ ها نشان دهنده دودمان های ویروسی مختلف شناسایی شده است.
تبلیغات
به عنوان محقق، ما موظفیم داده‌هایی تولید کنیم تا بتوانیم فرآیندهای پراکندگی پاتوژن‌های با پتانسیل بومی و اپیدمی را درک کنیم و در عین حال به مقامات بهداشتی و جمعیت اطلاع دهیم. مارتا، محقق اشاره کرد.
جریان
این مطالعه نشان می‌دهد که بیشتر موارد معرفی ویروس کرونا در برزیل قبل از اجرای اقدامات محدودکننده مانند تعطیلی مدارس و مشاغل رخ داده است. اکثر سویه ها از اروپا معرفی شده اند، با تخمین زده می شود 114 معرفی مستقل قبل از آوریل 2020. در شدیدترین دوره محدودیت ها، از آوریل تا اوت 2020، 33 معرفی ویروس کرونا ثبت شد.
با وجود تعداد زیاد واردات، با در نظر گرفتن کل دوره مورد تجزیه و تحلیل، تقریباً 10 برابر بیشتر رویدادهای صادراتی سویه ها از برزیل به خارج از کشور وجود داشت.
تبلیغات
پایگاه داده گسترده
این تحقیق بیش از 3,8 ژنوم Sars-CoV-2 را با مراجعه به موارد ثبت شده در هشت ایالت برزیل بین فوریه 2020 تا ژوئن 2021 تعیین توالی کرد. و پاراگوئه، Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) و Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) با سکانس‌سازی همکاری کردند.
حجم توالی ها حدود 20 درصد از کل ژنوم های رمزگشایی شده در برزیل را در طول دوره مطالعه نشان می دهد. در آنالیزهای انجام شده، محققان همچنین حدود 13 هزار ژنوم موجود در پایگاه های اطلاعاتی عمومی را با اشاره به موارد ثبت شده در کشور در این دوره مورد تجزیه و تحلیل قرار دادند که در مجموع به حدود 17 هزار ژنوم رسید. اطلاعات مربوط به موارد در پاراگوئه نیز مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.
منبع: خبرگزاری فیوکروز
