Äskettäin lehdessä julkaistu artikkeli Luonto mikrobiologia kertoo yksityiskohtaisesti koronaviruksen leviämisen dynamiikasta Brasiliassa ja tarjoaa muotokuvan kahdesta ensimmäisestä covid-19-aallosta. Työssä käsitellään muun muassa väestön liikkuvuuden roolia, matkustusrajoitustoimenpiteitä ja ensimmäisten muunnelmien syntymistä taudin leviämisessä.
MAINONTA
"Genomien luominen ja data-analyysi on ratkaisevan tärkeää taudinaiheuttajien evoluution ymmärtämisessä ja seurannassa, varsinkin kun otetaan huomioon useiden mikro-organismien, kuten Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya ja apinapox, kierto Brasiliassa. Tämä korostaa tarvetta pitää seurantajärjestelmät aktiivisina”, selittää artikkelin ensimmäinen kirjoittaja, KOK/Fiocruz Flavivirus Laboratoryn vieraileva tutkija Marta Giovanetti.
Oswaldo Cruz-instituutin (IOC/Fiocruz), Butantan-instituutin ja São Paulon yliopiston (USP) johtamaan tutkimukseen osallistui yli sata tutkijaa, jotka työskentelevät instituutioissa kahdeksassa maassa: Brasilia, Paraguay, Italia ja Etelä. Etelä-Afrikka, Iso-Britannia, Portugali, Yhdysvallat ja Australia.
Genomeja kaikkialta Brasiliasta
Tutkimuksessa analysoitiin genomeja kaikkialta Brasiliasta. Kartalla ympyrät osoittavat kutakin tilaa vastaavien geneettisten sekvenssien määrän. Kaaviossa värit osoittavat havaitut eri viruslinjat.
MAINONTA
”Meillä on tutkijoina velvollisuus tuottaa dataa, jotta voimme ymmärtää endeemisen ja epidemian potentiaalin omaavien taudinaiheuttajien leviämisprosesseja ja samalla tiedottaa terveysviranomaisille ja väestölle. Preprint mahdollistaa tämän nopean jakamisen”, tutkija Marta huomautti.
lähetys
Tutkimus huomauttaa, että suurin osa koronaviruksen leviämisestä Brasiliassa tapahtui ennen rajoittavien toimenpiteiden, kuten koulujen ja yritysten sulkemista, toteuttamista. Suurin osa kannoista on tuotu Euroopasta, arviolta 114 itsenäistä tartuntaa ennen huhtikuuta 2020. Kiihkeimmällä rajoituskaudella, huhtikuusta elokuuhun 2020, todettiin 33 koronaviruksen tartuntaa.
Suurista tuontimääristä huolimatta kantojen vientitapahtumia Brasiliasta ulkomaille oli noin 10 kertaa enemmän, kun otetaan huomioon koko tarkastelujakso.
MAINONTA
Laaja tietokanta
Tutkimuksessa sekvensoitiin yli 3,8 2 Sars-CoV-2020-genomia viitaten tapauksiin, jotka on rekisteröity kahdeksassa Brasilian osavaltiossa helmikuun 2021 ja kesäkuun XNUMX välisenä aikana. IOC/Fiocruzin, Instituto Butantanin ja USP:n lisäksi Central Public Health Laboratories (Lacens) viidestä Brasilian osavaltiosta ja Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) ja Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) tekivät yhteistyötä sekvensoinnin kanssa.
Sekvenssien määrä edustaa noin 20 % kaikista Brasiliassa tutkimusjakson aikana dekoodatuista genomeista. Analyyseissa tutkijat analysoivat myös noin 13 tuhatta julkisista tietokannoista saatavilla olevaa genomia viitaten maassa tällä ajanjaksolla rekisteröityihin tapauksiin, jolloin genomien kokonaismäärä oli noin 17 tuhatta. Myös Paraguayn tapauksia koskevia tietoja analysoitiin.
Lähde: Fiocruz News Agency
