A folyóiratban nemrég megjelent cikk Természet Microbiology részletezi a koronavírus terjedésének dinamikáját Brazíliában, és bemutatja a covid-19 első két hullámát. A munka többek között kitér a lakossági mobilitás szerepére, az utazáskorlátozó intézkedésekre és az első változatok megjelenésére a betegség terjedésében.
HIRDETŐ
„A genomok generálása és az adatok elemzése kulcsfontosságú a kórokozók fejlődésének megértéséhez és nyomon követéséhez, különös tekintettel a számos mikroorganizmus keringésére Brazíliában, mint például a Sars-CoV-2, a dengue-láz, a zika, a chikungunya és a majomhimlő stb. Ez rávilágít arra, hogy a megfigyelőrendszereket aktívan kell tartani” – magyarázza a cikk első szerzője, a NOB/Fiocruz Flavivírus Laboratórium vendégkutatója, Marta Giovanetti.
Az Oswaldo Cruz Intézet (IOC/Fiocruz), a Butantan Intézet és a São Paulo Egyetem (USP) által vezetett tanulmányban több mint száz tudós vett részt, akik nyolc ország intézményeiben dolgoznak: Brazília, Paraguay, Olaszország és Dél. Dél-Afrika, az Egyesült Királyság, Portugália, az Egyesült Államok és Ausztrália.
Genomok Brazília egész területéről
A tanulmány Brazília egész területéről származó genomokat elemzett. A térképen a körök az egyes állapotoknak megfelelő genetikai szekvenciák mennyiségét jelzik. A grafikonon a színek a különböző észlelt vírusvonalakat jelzik.
HIRDETŐ
„Kutatóként kötelességünk adatokat generálni, hogy megértsük az endémiás és járványos potenciállal rendelkező kórokozók terjedési folyamatait, és ezzel egyidejűleg tájékoztassuk az egészségügyi hatóságokat és a lakosságot. Az előnyomtatás lehetővé teszi ezt a gyors megosztást” – mutatott rá Marta kutató.
Folyó
A tanulmány rámutat, hogy Brazíliában a legtöbb koronavírus-fertőzés a korlátozó intézkedések, például az iskolák és a vállalkozások bezárása előtt történt. A törzsek többségét Európából hozták be, becslések szerint 114 áprilisa előtt 2020 független behurcolást végeztek. A korlátozások legintenzívebb időszakában, 2020 áprilisától augusztusáig 33 koronavírus-behurcolást regisztráltak.
A nagyszámú import ellenére a teljes vizsgált időszakot tekintve körülbelül 10-szer több volt a törzsek exportja Brazíliából külföldre.
HIRDETŐ
Kiterjedt adatbázis
A kutatás során több mint 3,8 Sars-CoV-2 genomot szekvenáltak nyolc brazil államban 2020 februárja és 2021 júniusa között regisztrált esetekre utalva. Az IOC/Fiocruz, az Instituto Butantan és az USP mellett öt brazil államból származó Central Public Health Laboratories (Lacens) is. és Paraguay, az Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) és a Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) működött együtt a szekvenálásban.
A szekvenciák mennyisége a Brazíliában a vizsgálati időszakban dekódolt teljes genom körülbelül 20%-át teszi ki. Az elemzések során a kutatók az országban regisztrált esetekre hivatkozva mintegy 13 ezer nyilvános adatbázisban elérhető genomot is elemeztek, így összesen mintegy 17 ezer genomot értek el. A paraguayi esetekkel kapcsolatos információkat is elemezték.
Forrás: Fiocruz hírügynökség
