Ուսումնասիրությունը բացահայտում է Covid-19 վիրուսի դինամիկան Բրազիլիայում

Բրազիլացի գիտնականները հաջորդականացրել են Sars-CoV-3,8-ի (որը առաջացնում է Covid-2) ավելի քան 19 գենոմ՝ կապված 2020 թվականի փետրվարից մինչև 2021 թվականի հունիս ընկած ժամանակահատվածում Բրազիլիայի ութ նահանգներում գրանցված դեպքերի հետ: Նպատակն էր հասկանալ, թե ինչպես է վիրուսը շրջանառվում և վերահսկել վիրուսի էվոլյուցիան: համաճարակ՝ հաշվի առնելով Բրազիլիայի բնակչության առանձնահատկությունները։

Վերջերս ամսագրում հրապարակված մի հոդված Nature մանրէաբանություն մանրամասնում է Բրազիլիայում կորոնավիրուսի շրջանառության դինամիկան և ներկայացնում է COVID-19-ի առաջին երկու ալիքների դիմանկարը։ Ի թիվս այլ արդյունքների, աշխատությունը քննարկում է բնակչության տեղաշարժի դերը, ճանապարհորդության սահմանափակման միջոցները և առաջին տարբերակների ի հայտ գալը հիվանդության տարածման գործում։

ՀՐԱՊԱՐԱԿԱԿԱՆՈՒԹՅՈՒՆ

«Գենոմների և տվյալների վերլուծության ստեղծումը կարևոր նշանակություն ունի պաթոգենների էվոլյուցիան հասկանալու և մոնիտորինգի համար, հատկապես հաշվի առնելով Բրազիլիայում բազմաթիվ միկրոօրգանիզմների շրջանառությունը, ինչպիսիք են Sars-CoV-2-ը, դենգե, զիկա, չիկունգունյա և կապիկություն և այլն: Սա ընդգծում է մոնիտորինգի համակարգերը ակտիվ պահելու անհրաժեշտությունը»,- բացատրում է հոդվածի առաջին հեղինակը՝ ՄՕԿ/Ֆիոկրուս Ֆլավիվիրուսի Լաբորատորիայի այցելու հետազոտող Մարտա Ջովանետտին:

Օսվալդո Կրուզի ինստիտուտի (ՄՕԿ/Ֆիոկրուս), Բուտանտանի ինստիտուտի և Սան Պաուլոյի համալսարանի (USP) ղեկավարությամբ ուսումնասիրությանը մասնակցել են հարյուրից ավելի գիտնականներ, ովքեր աշխատում են ութ երկրների հաստատություններում` Բրազիլիա, Պարագվայ, Իտալիա, Հարավային: Հարավային Աֆրիկա, Միացյալ Թագավորություն, Պորտուգալիա, Միացյալ Նահանգներ և Ավստրալիա:

Գենոմներ ամբողջ Բրազիլիայից

Աղբյուր՝ Giovanetti, M. et al. Nat Microbiol (արվեստ՝ Ջեֆերսոն Մենդես)

Ուսումնասիրությունը վերլուծել է գենոմները ամբողջ Բրազիլիայից: Քարտեզի վրա շրջանակները ցույց են տալիս յուրաքանչյուր վիճակին համապատասխանող գենետիկական հաջորդականությունների ծավալը։ Գրաֆիկում գույները ցույց են տալիս հայտնաբերված տարբեր վիրուսային տոհմերը:

ՀՐԱՊԱՐԱԿԱԿԱՆՈՒԹՅՈՒՆ

«Որպես հետազոտողներ՝ մենք պարտավոր ենք տվյալներ ստեղծել՝ փորձելով հասկանալ էնդեմիկ և համաճարակային ներուժ ունեցող պաթոգենների ցրման գործընթացները և միևնույն ժամանակ տեղեկացնել առողջապահական մարմիններին և բնակչությանը: Նախնական տպագրությունը թույլ է տալիս այս արագ փոխանակումը», - մատնանշեց հետազոտող Մարթան:

Հոսքային

Ուսումնասիրությունը մատնանշում է, որ Բրազիլիայում կորոնավիրուսային ներածությունների մեծ մասը տեղի է ունեցել նախքան սահմանափակող միջոցառումների իրականացումը, ինչպիսիք են դպրոցների և ձեռնարկությունների փակումը: Շտամների մեծ մասը ներմուծվել է Եվրոպայից՝ մինչև 114 թվականի ապրիլը գնահատվում է 2020 անկախ ներմուծում։ Սահմանափակումների ամենաինտենսիվ ժամանակահատվածում՝ 2020 թվականի ապրիլից օգոստոս, գրանցվել է կորոնավիրուսի 33 ներածություն։

Չնայած ներմուծումների մեծ քանակին, եղան մոտավորապես 10 անգամ ավելի շատ շտամների արտահանման դեպքեր Բրազիլիայից արտերկիր՝ հաշվի առնելով վերլուծված ամբողջ ժամանակահատվածը:

ՀՐԱՊԱՐԱԿԱԿԱՆՈՒԹՅՈՒՆ

Ընդարձակ բազա

Հետազոտությունը հաջորդականացրել է ավելի քան 3,8 Sars-CoV-2 գենոմը, որը վերաբերում է դեպքերին, որոնք գրանցվել են Բրազիլիայի ութ նահանգներում 2020 թվականի փետրվարից մինչև 2021 թվականի հունիսը: Ի լրումն ՄՕԿ/Ֆիոկրուսի, Ինստիտուտո Բուտանտանի և USP-ի, Կենտրոնական հանրային առողջության լաբորատորիաները (Lacens) Բրազիլիայի հինգ նահանգներից: և Պարագվայը, Instituto Carlos Chagas-ը (Fiocruz-Parana) և Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) համագործակցել են հաջորդականության հետ:

Հերթականությունների ծավալը ներկայացնում է ուսումնասիրության ընթացքում Բրազիլիայում վերծանված ընդհանուր գենոմների մոտ 20%-ը: Վերլուծությունների ընթացքում հետազոտողները նաև վերլուծել են շուրջ 13 հազար գենոմներ, որոնք առկա են տվյալ ժամանակահատվածում երկրում գրանցված դեպքերի վերաբերյալ հանրային տվյալների բազաներում՝ հասնելով մոտ 17 հազար գենոմի։ Վերլուծվել է նաև Պարագվայում դեպքերի վերաբերյալ տեղեկությունները։

Աղբյուր՝ Fiocruz News Agency

Ոլորեք վերև