מאמר שהתפרסם לאחרונה במגזין מיקרוביולוגיה טבע מפרט את הדינמיקה של מחזור הקורונה בברזיל ומספק דיוקן של שני הגלים הראשונים של קוביד-19. בין שאר התוצאות, העבודה דנה בתפקיד ניידות האוכלוסייה, אמצעים להגבלת נסיעות והופעת הווריאציות הראשונות בהתפשטות המחלה.
פִּרסוּם
"יצירת גנומים וניתוח נתונים חיוניים להבנה ולמעקב אחר התפתחות הפתוגנים, במיוחד בהתחשב במחזור של מיקרואורגניזמים מרובים בברזיל, כמו Sars-CoV-2, דנגי, זיקה, צ'יקונגוניה ואבעבועות קופים, בין היתר. זה מדגיש את הצורך לשמור על מערכות ניטור פעילות", מסבירה המחברת הראשונה של המאמר, החוקרת האורחת במעבדת IOC/Fiocruz Flavivirus, Marta Giovanetti.
בהובלת מכון אוסוולדו קרוז (IOC/Fiocruz), מכון בוטנטן ואוניברסיטת סאו פאולו (USP), המחקר כלל השתתפות של יותר ממאה מדענים, העובדים במוסדות בשמונה מדינות: ברזיל, פרגוואי, איטליה, דרום אפריקה דרום, בריטניה, פורטוגל, ארצות הברית ואוסטרליה.
גנומים מכל רחבי ברזיל
המחקר ניתח גנומים מכל רחבי ברזיל. במפה, העיגולים מציינים את נפח הרצפים הגנטיים המתאימים לכל מצב. בגרף, הצבעים מציינים את השושלות הוויראליות השונות שזוהו.
פִּרסוּם
"כחוקרים, יש לנו חובה לייצר נתונים כדי לנסות להבין את תהליכי הפיזור של פתוגנים בעלי פוטנציאל אנדמי ומגיפה, ובמקביל ליידע את רשויות הבריאות והאוכלוסייה. ההדפסה המוקדמת מאפשרת שיתוף מהיר זה", ציינה החוקרת מרתה.
הילוכים
המחקר מצביע על כך שרוב כניסות הקורונה בברזיל התרחשו לפני יישום צעדים מגבילים, כגון סגירת בתי ספר ועסקים. רוב הזנים הוכנסו מאירופה, עם הערכה של 114 כניסות עצמאיות לפני אפריל 2020. בתקופת ההגבלות האינטנסיבית ביותר, מאפריל עד אוגוסט 2020, נרשמו 33 כניסות של נגיף הקורונה.
למרות הכמות הגדולה של היבוא, היו בערך פי 10 יותר אירועי יצוא של זנים מברזיל לחו"ל, בהתחשב בכל התקופה שניתחה.
פִּרסוּם
מסד נתונים נרחב
המחקר רצף יותר מ-3,8 גנומים Sars-CoV-2 המתייחסים למקרים שנרשמו בשמונה מדינות ברזיל בין פברואר 2020 ליוני 2021. בנוסף ל-IOC/Fiocruz, Instituto Butantan ו-USP, מעבדות מרכזיות לבריאות הציבור (Lacens) מחמש מדינות ברזיל. ופרגוואי, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) וה- Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) שיתפו פעולה עם הרצף.
נפח הרצפים מייצג כ-20% מסך הגנום שפוענחו בברזיל במהלך תקופת המחקר. במסגרת הניתוחים ניתחו החוקרים גם כ-13 אלף גנומים הזמינים במאגרי מידע ציבוריים המתייחסים למקרים שנרשמו בארץ בתקופה, והגיעו לסך של כ-17 אלף גנומים. כמו כן נותח מידע על מקרים בפרגוואי.
מקור: סוכנות הידיעות פיוקרוז
