Sebuah artikel baru-baru ini diterbitkan dalam majalah Alam Mikrobiologi memperincikan dinamik peredaran coronavirus di Brazil dan menyediakan potret dua gelombang pertama covid-19. Antara hasil lain, kerja itu membincangkan peranan mobiliti penduduk, langkah sekatan perjalanan dan kemunculan varian pertama dalam penyebaran penyakit itu.
PUBLISITI
“Penjanaan genom dan analisis data adalah penting untuk memahami dan memantau evolusi patogen, terutamanya dengan mengambil kira peredaran pelbagai mikroorganisma di Brazil, seperti Sars-CoV-2, denggi, zika, chikungunya dan monkeypox, antara lain. Ini menyerlahkan keperluan untuk memastikan sistem pemantauan aktif”, jelas pengarang pertama artikel itu, penyelidik pelawat di Makmal Flavivirus IOC/Fiocruz, Marta Giovanetti.
Diketuai oleh Institut Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), Institut Butantan dan Universiti São Paulo (USP), kajian itu termasuk penyertaan lebih daripada seratus saintis, yang bekerja di institusi di lapan negara: Brazil, Paraguay, Itali, Selatan Afrika Selatan, United Kingdom, Portugal, Amerika Syarikat dan Australia.
Genom dari seluruh Brazil
Kajian itu menganalisis genom dari seluruh Brazil. Pada peta, bulatan menunjukkan isipadu jujukan genetik yang sepadan dengan setiap keadaan. Dalam graf, warna menunjukkan keturunan virus berbeza yang dikesan.
PUBLISITI
“Sebagai penyelidik, kami mempunyai kewajipan untuk menjana data untuk cuba memahami proses penyebaran patogen dengan potensi endemik dan wabak dan, pada masa yang sama, memaklumkan kepada pihak berkuasa kesihatan dan penduduk. Pracetak membolehkan perkongsian pantas ini”, kata penyelidik Marta.
Penstriman
Kajian itu menunjukkan bahawa kebanyakan pengenalan koronavirus di Brazil berlaku sebelum pelaksanaan langkah-langkah sekatan, seperti penutupan sekolah dan perniagaan. Majoriti strain diperkenalkan dari Eropah, dengan anggaran 114 pengenalan bebas sebelum April 2020. Dalam tempoh sekatan yang paling sengit, dari April hingga Ogos 2020, 33 pengenalan coronavirus telah direkodkan.
Walaupun bilangan import yang besar, terdapat kira-kira 10 kali lebih banyak peristiwa eksport strain dari Brazil ke luar negara, memandangkan keseluruhan tempoh dianalisis.
PUBLISITI
Pangkalan data yang luas
Penyelidikan itu menyusun lebih daripada 3,8 genom Sars-CoV-2 merujuk kepada kes yang didaftarkan di lapan negeri Brazil antara Februari 2020 dan Jun 2021. Selain IOC/Fiocruz, Instituto Butantan dan USP, Central Public Health Laboratories ( Lacens) dari lima negeri Brazil dan Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) dan Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) bekerjasama dengan penjujukan.
Jumlah jujukan mewakili sekitar 20% daripada jumlah genom yang dinyahkod di Brazil semasa tempoh kajian. Dalam analisis itu, para penyelidik juga menganalisis sekitar 13 ribu genom yang terdapat dalam pangkalan data awam merujuk kepada kes yang didaftarkan di negara itu dalam tempoh itu, mencapai jumlah kira-kira 17 ribu genom. Maklumat berkenaan kes-kes di Paraguay turut dianalisis.
Sumber: Agensi Berita Fiocruz
