En artikkel nylig publisert i bladet Nature Mikrobiologi beskriver dynamikken i koronavirussirkulasjonen i Brasil og gir et portrett av de to første bølgene av covid-19. Blant andre resultater diskuterer arbeidet rollen til befolkningsmobilitet, reisebegrensende tiltak og fremveksten av de første variantene i spredningen av sykdommen.
REKLAME
"Genereringen av genomer og dataanalyse er avgjørende for å forstå og overvåke utviklingen av patogener, spesielt med tanke på sirkulasjonen av flere mikroorganismer i Brasil, slik som Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya og apekopper, blant andre. Dette fremhever behovet for å holde overvåkingssystemene aktive”, forklarer førsteforfatteren av artikkelen, gjesteforskeren ved IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory, Marta Giovanetti.
Ledet av Oswaldo Cruz Institute (IOC/Fiocruz), Butantan Institute og University of São Paulo (USP), inkluderte studien deltakelse av mer enn hundre forskere, som jobber i institusjoner i åtte land: Brasil, Paraguay, Italia, Sør Afrika Sør, Storbritannia, Portugal, USA og Australia.
Genomer fra hele Brasil
Studien analyserte genomer fra hele Brasil. På kartet indikerer sirklene volumet av genetiske sekvenser som tilsvarer hver tilstand. I grafen indikerer fargene de forskjellige virale avstamningene som er oppdaget.
REKLAME
«Som forskere har vi en forpliktelse til å generere data for å prøve å forstå spredningsprosessene til patogener med endemisk og epidemisk potensial og samtidig informere helsemyndighetene og befolkningen. Fortrykket gir mulighet for denne raske delingen, påpekte forsker Marta.
transmisjon
Studien peker på at de fleste introduksjoner av koronavirus i Brasil skjedde før innføringen av restriktive tiltak, som nedleggelse av skoler og bedrifter. Flertallet av stammene ble introdusert fra Europa, med anslagsvis 114 uavhengige introduksjoner før april 2020. I den mest intense perioden med restriksjoner, fra april til august 2020, ble det registrert 33 introduksjoner av koronaviruset.
Til tross for det store antallet import, var det omtrent 10 ganger flere eksporthendelser av stammer fra Brasil til utlandet, tatt i betraktning hele perioden som ble analysert.
REKLAME
Omfattende database
Forskningen sekvenserte mer enn 3,8 Sars-CoV-2-genomer som refererte til tilfeller registrert i åtte brasilianske stater mellom februar 2020 og juni 2021. I tillegg til IOC/Fiocruz, Instituto Butantan og USP, Central Public Health Laboratories (Lacens) fra fem brasilianske stater og Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) og Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) samarbeidet med sekvenseringen.
Volumet av sekvenser representerer rundt 20 % av de totale genomene dekodet i Brasil i løpet av studieperioden. I analysene analyserte forskerne også rundt 13 tusen genomer tilgjengelig i offentlige databaser med henvisning til tilfeller registrert i landet i perioden, og nådde totalt cirka 17 tusen genom. Informasjon om saker i Paraguay ble også analysert.
Kilde: Fiocruz News Agency
