Un articol publicat recent în revistă Natura Microbiologie detaliază dinamica circulației coronavirusului în Brazilia și oferă un portret al primelor două valuri de covid-19. Printre alte rezultate, lucrarea discută rolul mobilității populației, măsurile de restricție a călătoriilor și apariția primelor variante în răspândirea bolii.
PUBLICITATE
„Generarea de genomuri și analiza datelor este crucială pentru înțelegerea și monitorizarea evoluției agenților patogeni, în special având în vedere circulația mai multor microorganisme în Brazilia, cum ar fi Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya și variola maimuțelor, printre altele. Acest lucru evidențiază nevoia de a menține sistemele de monitorizare active”, explică primul autor al articolului, cercetătorul vizitator la Laboratorul IOC/Fiocruz Flavivirus, Marta Giovanetti.
Condus de Institutul Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz), Institutul Butantan și Universitatea din São Paulo (USP), studiul a inclus participarea a peste o sută de oameni de știință, care lucrează în instituții din opt țări: Brazilia, Paraguay, Italia, Sud Africa de Sud, Regatul Unit, Portugalia, Statele Unite și Australia.
Genoame din toată Brazilia
Studiul a analizat genomi din toată Brazilia. Pe hartă, cercurile indică volumul de secvențe genetice corespunzător fiecărei stări. În grafic, culorile indică diferitele linii virale detectate.
PUBLICITATE
„În calitate de cercetători, avem obligația de a genera date pentru a încerca să înțelegem procesele de dispersie a agenților patogeni cu potențial endemic și epidemic și, în același timp, să informăm autoritățile sanitare și populația. Preprintul permite această partajare rapidă”, a subliniat cercetătorul Marta.
Streaming
Studiul subliniază că majoritatea introducerilor de coronavirus în Brazilia au avut loc înainte de implementarea măsurilor restrictive, cum ar fi închiderea școlilor și a întreprinderilor. Majoritatea tulpinilor au fost introduse din Europa, cu aproximativ 114 introduceri independente înainte de aprilie 2020. În cea mai intensă perioadă de restricții, din aprilie până în august 2020, s-au înregistrat 33 de introduceri ale coronavirusului.
În ciuda numărului mare de importuri, au existat de aproximativ 10 ori mai multe evenimente de export de tulpini din Brazilia în străinătate, luând în considerare întreaga perioadă analizată.
PUBLICITATE
Baza de date extinsa
Cercetarea a secvențiat peste 3,8 de genomi Sars-CoV-2 referitor la cazurile înregistrate în opt state braziliene între februarie 2020 și iunie 2021. Pe lângă IOC/Fiocruz, Instituto Butantan și USP, laboratoarele centrale de sănătate publică (Lacens) din cinci state braziliene și Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) și Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) au colaborat cu secvențierea.
Volumul secvențelor reprezintă aproximativ 20% din totalul genomilor decodificați în Brazilia în perioada de studiu. În analize, cercetătorii au analizat și în jur de 13 mii de genomi disponibile în bazele de date publice referitoare la cazurile înregistrate în țară în perioada respectivă, ajungând la un total de aproximativ 17 mii de genomi. De asemenea, au fost analizate informații privind cazurile din Paraguay.
Sursa: Agentia de presa Fiocruz
