Чланак недавно објављен у часопису Природа микробиологија детаљно описује динамику циркулације коронавируса у Бразилу и даје портрет прва два таласа Цовид-19. Између осталих резултата, у раду се говори о улози мобилности становништва, мерама ограничења путовања и појави првих варијанти у ширењу болести.
ОГЛАШАВАЊЕ
„Генерација генома и анализа података је кључна за разумевање и праћење еволуције патогена, посебно имајући у виду циркулацију више микроорганизама у Бразилу, као што су Сарс-ЦоВ-2, денга, зика, чикунгуња и богиње мајмуна, између осталих. Ово наглашава потребу да системи за праћење буду активни“, објашњава први аутор чланка, гостујући истраживач у лабораторији за флавивирус МОК/Фиокруз, Марта Ђованети.
Предвођена Институтом Освалдо Круз (ИОЦ/Фиокруз), Институтом Бутантан и Универзитетом у Сао Паолу (УСП), студија је укључила учешће више од стотину научника, који раде у институцијама у осам земаља: Бразилу, Парагвају, Италији, Јужном Јужна Африка, Уједињено Краљевство, Португал, Сједињене Државе и Аустралија.
Геноми из целог Бразила
Студија је анализирала геноме из целог Бразила. На мапи, кругови означавају обим генетских секвенци које одговарају сваком стању. На графикону, боје означавају различите откривене вирусне линије.
ОГЛАШАВАЊЕ
„Као истраживачи, имамо обавезу да генеришемо податке како бисмо покушали да разумемо процесе дисперзије патогена са ендемским и епидемијским потенцијалом и, истовремено, обавестимо здравствене власти и становништво. Препринт омогућава ово брзо дељење“, истакла је истраживач Марта.
Стреаминг
Студија истиче да се већина уношења корона вируса у Бразилу догодила пре примене рестриктивних мера, попут затварања школа и предузећа. Већина сојева је унета из Европе, са процењеним 114 независних уношења пре априла 2020. У најинтензивнијем периоду рестрикција, од априла до августа 2020, забележена су 33 уношења корона вируса.
И поред великог броја увоза, било је приближно 10 пута више извозних догађаја сојева из Бразила у иностранство, с обзиром на цео анализирани период.
ОГЛАШАВАЊЕ
Екстензивна база података
Истраживање је секвенционирало више од 3,8 генома Сарс-ЦоВ-2 који се односе на случајеве регистроване у осам бразилских држава између фебруара 2020. и јуна 2021. Поред ИОЦ/Фиокруза, Институто Бутантан и УСП, Централне лабораторије за јавно здравље (Лаценс) из пет бразилских држава и Парагвај, Институто Царлос Цхагас (Фиокруз-Парана) и Хемоцентро де Рибеирао Прето (СП) сарађивали су у секвенцирању.
Обим секвенци представља око 20% укупних генома декодираних у Бразилу током периода истраживања. У анализама, истраживачи су анализирали и око 13 хиљада генома доступних у јавним базама података који се односе на случајеве регистроване у земљи у том периоду, достигавши укупно око 17 хиљада генома. Анализиране су и информације о случајевима у Парагвају.
Извор: Новинска агенција Фиокруз
