En artikel som nyligen publicerats i tidningen Natur Mikrobiologi beskriver dynamiken i coronavirusets cirkulation i Brasilien och ger ett porträtt av de två första vågorna av covid-19. Arbetet diskuterar bland annat befolkningens mobilitets roll, resebegränsningsåtgärder och uppkomsten av de första varianterna av sjukdomens spridning.
REKLAM
"Genereringen av genom och dataanalys är avgörande för att förstå och övervaka utvecklingen av patogener, särskilt med tanke på cirkulationen av flera mikroorganismer i Brasilien, såsom Sars-CoV-2, dengue, zika, chikungunya och apkoppor, bland andra. Detta understryker behovet av att hålla övervakningssystem aktiva”, förklarar artikelns första författare, gästforskaren vid IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory, Marta Giovanetti.
Ledd av Oswaldo Cruz Institute (IOC/Fiocruz), Butantan Institute och University of São Paulo (USP), inkluderade studien deltagande av mer än hundra forskare, som arbetar på institutioner i åtta länder: Brasilien, Paraguay, Italien, Syd. Sydafrika, Storbritannien, Portugal, USA och Australien.
Genom från hela Brasilien
Studien analyserade genom från hela Brasilien. På kartan anger cirklarna volymen av genetiska sekvenser som motsvarar varje tillstånd. I grafen indikerar färgerna de olika virala härkomsterna som upptäckts.
REKLAM
”Som forskare har vi en skyldighet att generera data för att försöka förstå spridningsprocesserna för patogener med endemisk och epidemipotential och samtidigt informera hälsomyndigheter och befolkningen. Förtrycket möjliggör denna snabba delning”, påpekade forskaren Marta.
Strömning
Studien påpekar att de flesta introduktioner av coronaviruset i Brasilien inträffade innan de restriktiva åtgärderna implementerades, såsom stängning av skolor och företag. Majoriteten av stammar introducerades från Europa, med uppskattningsvis 114 oberoende introduktioner före april 2020. Under den mest intensiva perioden av restriktioner, från april till augusti 2020, registrerades 33 introduktioner av coronaviruset.
Trots det stora antalet importer var det cirka 10 gånger fler exporthändelser av stammar från Brasilien till utlandet, med tanke på hela den analyserade perioden.
REKLAM
Omfattande databas
Forskningen sekvenserade mer än 3,8 2 Sars-CoV-2020-genom som hänvisade till fall registrerade i åtta brasilianska delstater mellan februari 2021 och juni XNUMX. Förutom IOC/Fiocruz, Instituto Butantan och USP, Central Public Health Laboratories (Lacens) från fem brasilianska delstater och Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) och Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) samarbetade med sekvenseringen.
Volymen av sekvenser representerar cirka 20 % av det totala genomet som avkodats i Brasilien under studieperioden. I analyserna analyserade forskarna också cirka 13 tusen genom tillgängliga i offentliga databaser med hänvisning till fall som registrerats i landet under perioden, och nådde totalt cirka 17 tusen genom. Information om fall i Paraguay analyserades också.
Källa: Fiocruz News Agency
