บทความที่เพิ่งตีพิมพ์ในนิตยสาร จุลชีววิทยาธรรมชาติ ให้รายละเอียดเกี่ยวกับพลวัตของการไหลเวียนของไวรัสโคโรนาในบราซิล และแสดงภาพคลื่นลูกแรกของ Covid-19 ท่ามกลางผลลัพธ์อื่นๆ งานวิจัยนี้ได้กล่าวถึงบทบาทของการเคลื่อนย้ายของประชากร มาตรการจำกัดการเดินทาง และการเกิดขึ้นของตัวแปรแรกๆ ในการแพร่กระจายของโรค
การเผยแพร่
“การสร้างจีโนมและการวิเคราะห์ข้อมูลมีความสำคัญอย่างยิ่งต่อการทำความเข้าใจและติดตามวิวัฒนาการของเชื้อโรค โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อพิจารณาถึงการไหลเวียนของจุลินทรีย์หลายชนิดในบราซิล เช่น Sars-CoV-2 ไข้เลือดออก ซิกา ชิคุนกุนยา และโรคฝีลิง และอื่นๆ อีกมากมาย สิ่งนี้เน้นย้ำถึงความจำเป็นในการทำให้ระบบการตรวจสอบมีความเคลื่อนไหวอยู่เสมอ” Marta Giovanetti ผู้เขียนบทความคนแรก ซึ่งเป็นนักวิจัยรับเชิญจาก IOC/Fiocruz Flavivirus Laboratory อธิบาย
การศึกษานี้นำโดยสถาบัน Oswaldo Cruz (IOC/Fiocruz) สถาบัน Butantan และมหาวิทยาลัยเซาเปาโล (USP) โดยครอบคลุมการมีส่วนร่วมของนักวิทยาศาสตร์กว่าร้อยคนที่ทำงานในสถาบันต่างๆ ใน 8 ประเทศ ได้แก่ บราซิล ปารากวัย อิตาลี และภาคใต้ แอฟริกาตอนใต้ สหราชอาณาจักร โปรตุเกส สหรัฐอเมริกา และออสเตรเลีย
จีโนมจากทั่วบราซิล
การศึกษาวิเคราะห์จีโนมจากทั่วประเทศบราซิล บนแผนที่ วงกลมแสดงถึงปริมาณของลำดับพันธุกรรมที่สอดคล้องกับแต่ละสถานะ ในกราฟ สีต่างๆ บ่งบอกถึงเชื้อสายของไวรัสต่างๆ ที่ตรวจพบ
การเผยแพร่
“ในฐานะนักวิจัย เรามีภาระหน้าที่ในการสร้างข้อมูลเพื่อพยายามทำความเข้าใจกระบวนการแพร่กระจายของเชื้อโรคที่มีศักยภาพในการแพร่ระบาดและแพร่กระจาย และในขณะเดียวกันก็แจ้งให้หน่วยงานด้านสุขภาพและประชากรทราบด้วย การพิมพ์ล่วงหน้าช่วยให้สามารถแบ่งปันได้อย่างรวดเร็ว” นักวิจัย Marta ชี้ให้เห็น
สตรีมมิ่ง
การศึกษาชี้ให้เห็นว่าการแพร่กระจายของไวรัสโคโรนาส่วนใหญ่ในบราซิลเกิดขึ้นก่อนที่จะมีการใช้มาตรการที่เข้มงวด เช่น การปิดโรงเรียนและธุรกิจต่างๆ สายพันธุ์ส่วนใหญ่นำเข้าจากยุโรป โดยมีประมาณ 114 การแนะนำโดยหน่วยงานอิสระก่อนเดือนเมษายน 2020 ในช่วงที่มีการจำกัดที่เข้มงวดที่สุด ตั้งแต่เดือนเมษายนถึงเดือนสิงหาคม 2020 มีการบันทึกการแนะนำไวรัสโคโรนา 33 ครั้ง
แม้จะมีการนำเข้าจำนวนมาก แต่ก็มีเหตุการณ์การส่งออกสายพันธุ์จากบราซิลไปยังต่างประเทศมากกว่าประมาณ 10 เท่า เมื่อพิจารณาตลอดระยะเวลาที่วิเคราะห์
การเผยแพร่
ฐานข้อมูลที่กว้างขวาง
การวิจัยได้จัดลำดับจีโนม Sars-CoV-3,8 มากกว่า 2 รายการที่อ้างอิงถึงเคสที่จดทะเบียนใน 2020 รัฐของบราซิลระหว่างเดือนกุมภาพันธ์ 2021 ถึงมิถุนายน XNUMX นอกเหนือจาก IOC/Fiocruz, Instituto Butantan และ USP แล้ว Central Public Health Laboratories (Lacens) จาก XNUMX รัฐของบราซิล และปารากวัย Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) และ Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) ร่วมมือกับการจัดลำดับ
ปริมาณของลำดับคิดเป็นประมาณ 20% ของจีโนมทั้งหมดที่ถอดรหัสในบราซิลในช่วงระยะเวลาการศึกษา ในการวิเคราะห์ นักวิจัยยังได้วิเคราะห์จีโนมประมาณ 13 ชนิดที่มีอยู่ในฐานข้อมูลสาธารณะ ซึ่งอ้างอิงถึงคดีที่จดทะเบียนในประเทศในช่วงเวลาดังกล่าว ซึ่งมีจำนวนจีโนมทั้งหมดประมาณ 17 จีโนม ข้อมูลเกี่ยวกับคดีในปารากวัยก็ได้รับการวิเคราะห์ด้วย
ที่มา: สำนักข่าวฟิโอครูซ
