Geçtiğimiz günlerde dergide yayınlanan bir makale Doğa Mikrobiyoloji Brezilya'daki koronavirüs dolaşımının dinamiklerini detaylandırıyor ve covid-19'un ilk iki dalgasının bir portresini sunuyor. Çalışma, diğer sonuçların yanı sıra nüfus hareketliliğinin, seyahat kısıtlama önlemlerinin ve hastalığın yayılmasında ilk varyantların ortaya çıkmasının rolünü tartışıyor.
YAYINLANDIRMA
"Genomların oluşturulması ve veri analizi, özellikle diğerlerinin yanı sıra Sars-CoV-2, dang humması, zika, chikungunya ve maymun çiçeği gibi Brezilya'daki birden fazla mikroorganizmanın dolaşımı göz önüne alındığında, patojenlerin evrimini anlamak ve izlemek için çok önemlidir. Bu, izleme sistemlerini aktif tutma ihtiyacını vurgulamaktadır”, diye açıklıyor makalenin ilk yazarı, IOC/Fiocruz Flavivirüs Laboratuvarı'nda misafir araştırmacı olan Marta Giovanetti.
Oswaldo Cruz Enstitüsü (IOC/Fiocruz), Butantan Enstitüsü ve São Paulo Üniversitesi (USP) tarafından yürütülen çalışma, sekiz ülkedeki kurumlarda çalışan yüzden fazla bilim insanının katılımını içeriyordu: Brezilya, Paraguay, İtalya, Güney. Afrika Güney, Birleşik Krallık, Portekiz, Amerika Birleşik Devletleri ve Avustralya.
Brezilya'nın her yerinden genomlar
Çalışma Brezilya'nın her yerinden genomları analiz etti. Haritadaki daireler, her bir duruma karşılık gelen genetik dizilerin hacmini gösterir. Grafikte renkler tespit edilen farklı viral soyları göstermektedir.
YAYINLANDIRMA
“Araştırmacılar olarak, endemik ve salgın potansiyeli olan patojenlerin dağılım süreçlerini anlamaya çalışmak için veri üretme ve aynı zamanda sağlık otoritelerini ve toplumu bilgilendirme yükümlülüğümüz var. Ön baskı bu hızlı paylaşıma olanak sağlıyor” diye belirtti araştırmacı Marta.
Yayın Akışı
Çalışma, Brezilya'da koronavirüsün ortaya çıkışının çoğunun, okulların ve işletmelerin kapatılması gibi kısıtlayıcı önlemlerin uygulanmasından önce gerçekleştiğine dikkat çekiyor. Türlerin çoğunluğu Avrupa'dan getirilmiş olup, Nisan 114'den önce tahminen 2020 bağımsız giriş yapılmıştır. Kısıtlamaların en yoğun olduğu dönem olan Nisan-Ağustos 2020'de, 33 koronavirüs girişi kaydedilmiştir.
Çok sayıda ithalata rağmen, analiz edilen tüm dönem göz önüne alındığında, Brezilya'dan yurt dışına yaklaşık 10 kat daha fazla tür ihracatı gerçekleşti.
YAYINLANDIRMA
Kapsamlı veritabanı
Araştırma, Şubat 3,8 ile Haziran 2 arasında sekiz Brezilya eyaletinde kaydedilen vakalara atıfta bulunan 2020'den fazla Sars-CoV-2021 genomunu sıraladı. IOC/Fiocruz, Instituto Butantan ve USP'nin yanı sıra beş Brezilya eyaletinden Merkezi Halk Sağlığı Laboratuvarları (Lacens) ve Paraguay, Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) ve Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) sıralama konusunda işbirliği yaptı.
Dizilerin hacmi, çalışma dönemi boyunca Brezilya'da kodu çözülen toplam genomların yaklaşık %20'sini temsil etmektedir. Analizlerde araştırmacılar, aynı zamanda ülkede o dönemde kayıtlı vakalara ilişkin kamuya açık veritabanlarında bulunan yaklaşık 13 bin genomu da analiz ederek toplamda yaklaşık 17 bin genoma ulaştı. Paraguay'daki vakalara ilişkin bilgiler de analiz edildi.
Kaynak: Fiocruz Haber Ajansı
