最近发表在杂志上的一篇文章 自然微生物学 详细介绍了巴西冠状病毒的传播动态，并提供了前两波 covid-19 的概况。除其他结果外，该工作还讨论了人口流动、旅行限制措施以及第一批变种在疾病传播中的作用。
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“基因组的生成和数据分析对于理解和监测病原体的进化至关重要，特别是考虑到多种微生物在巴西的传播，例如 Sars-CoV-2、登革热、寨卡、基孔肯雅热和猴痘等。这凸显了保持监测系统活跃的必要性”，该文章的第一作者、IOC/Fiocruz Flavivirus 实验室的客座研究员 Marta Giovanetti 解释道。
该研究由奥斯瓦尔多·克鲁兹研究所 (IOC/Fiocruz)、布坦坦研究所和圣保罗大学 (USP) 牵头，有 100 多名科学家参与，他们在八个国家的机构工作：巴西、巴拉圭、意大利、南苏丹南部非洲、英国、葡萄牙、美国和澳大利亚。
来自巴西各地的基因组
该研究分析了巴西各地的基因组。在地图上，圆圈表示每个州对应的基因序列的体积。在图中，颜色表示检测到的不同病毒谱系。
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“作为研究人员，我们有义务生成数据，以尝试了解具有地方性和流行性潜力的病原体的传播过程，同时告知卫生当局和民众。预印本允许这种快速共享”，研究员玛塔指出。
传输
研究指出，巴西大多数冠状病毒的传入发生在关闭学校和企业等限制性措施实施之前。大多数毒株来自欧洲，114 年 2020 月之前估计有 2020 起独立传入事件。在限制最严格的时期，即 33 年 XNUMX 月至 XNUMX 月，记录了 XNUMX 起冠状病毒传入事件。
尽管进口量很大，但考虑到整个分析时期，从巴西向国外出口菌株的事件大约增加了 10 倍。
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丰富的数据库
该研究对 3,8 年 2 月至 2020 年 2021 月期间在巴西八个州登记的病例的 XNUMX 多个 Sars-CoV-XNUMX 基因组进行了测序。除了 IOC/Fiocruz、Instituto Butantan 和 USP 之外，还有来自巴西五个州的中央公共卫生实验室 (Lacens)巴拉圭、Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) 和 Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) 合作进行了测序。
序列量约占研究期间巴西解码的基因组总数的 20%。在分析中，研究人员还分析了公共数据库中大约 13 万个基因组，涉及该国同期登记的病例，基因组总数约为 17 万个。还分析了有关巴拉圭案件的信息。
资料来源：菲奥克鲁斯通讯社
