最近發表在雜誌上的一篇文章 自然微生物學 詳細介紹了巴西冠狀病毒的傳播動態，並提供了前兩波 covid-19 的概況。除其他結果外，該工作還討論了人口流動、旅行限制措施以及第一批變種在疾病傳播中的作用。
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「基因組的產生和數據分析對於理解和監測病原體的進化至關重要，特別是考慮到多種微生物在巴西的傳播，例如Sars-CoV-2、登革熱、寨卡、基孔肯雅熱和猴痘等。這凸顯了保持監測系統活躍的必要性”，該文章的第一作者、IOC/Fiocruz Flavivirus 實驗室的客座研究員 Marta Giovanetti 解釋道。
這項研究由奧斯瓦爾多·克魯茲研究所(IOC/Fiocruz)、布坦坦研究所和聖保羅大學(USP) 牽頭，有100 多名科學家參與，他們在八個國家的機構工作：巴西、巴拉圭、義大利、南蘇丹南部非洲、英國、葡萄牙、美國和澳洲。
來自巴西各地的基因組
該研究分析了巴西各地的基因組。在地圖上，圓圈表示每個州對應的基因序列的體積。在圖中，顏色表示檢測到的不同病毒譜系。
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「作為研究人員，我們有義務產生數據，以嘗試了解具有地方性和流行性潛力的病原體的傳播過程，同時告知衛生當局和民眾。預印本允許這種快速共享”，研究員瑪塔指出。
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研究指出，巴西大多數冠狀病毒的傳入發生在關閉學校和企業等限制性措施實施之前。大多數病毒株來自歐洲，114 年 2020 月之前估計有 2020 起獨立傳入事件。在限制最嚴格的時期，即 33 年 XNUMX 月至 XNUMX 月，記錄了 XNUMX 起冠狀病毒傳入事件。
儘管進口量很大，但考慮到整個分析時期，從巴西向國外出口菌株的事件增加了約 10 倍。
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豐富的資料庫
該研究對3,8 年2 月至2020 年2021 月期間在巴西八個州登記的病例的XNUMX 多個Sars-CoV-XNUMX 基因組進行了測序。除了IOC/Fiocruz、Instituto Butantan 和USP 之外，還有來自定序。除了IOC/Fiocruz、Instituto Butantan 和USP 之外，還有來自巴西五個州的中央公共衛生實驗室(Lacens)巴拉圭、Instituto Carlos Chagas (Fiocruz-Paraná) 和 Hemocentro de Ribeirão Preto (SP) 合作進行了定序。
序列量約佔研究期間巴西解碼的基因組總數的 20%。在分析中，研究人員還分析了公共資料庫中約 13 萬個基因組，涉及該國同期登記的病例，基因組總數約為 17 萬個。也分析了有關巴拉圭案件的資訊。
資料來源：菲奧克魯斯通訊社
